体育部成立于2017年底，属金陵科技学院二级教学管理单位，下设综合办公室、教务管理办公室、两个教研室（第一教研室、第二教研室）、两个中心（场馆器材中心和学生体质监测中心）、一个分校区办公室（幕府校区办公室）。

体育部现有在职教工39人，其中处级干部2人，行政人员4人，专职教师33人。教师队伍中教授1人、副教授13人，讲师15人，助教4人，博士2人，在读博士3人，国家级裁判1人，国家一级裁判17人。国家级体育健身教练1人，运动健将3人，一级运动员4人，12人获得中国红十字会颁发的“救护师资证书”。

体育部主要承担全校的体育教学、运动训练、体育科研、学生体质健康测试以及全校师生校内、外竞赛的开展、社会服务等各项工作。开设基础课1门，专项课18门，保健课1门。成立了12支校运动队，在近几年的国赛、省赛中取得了骄人的成绩。每年度举办校运动会等10多项专项比赛，充分调动了学生运动积极性。